「海量资料」会红也不是没有塬因的,Facebook每天跟你说「你可能认识的朋友…」、购物网站告诉你「买了这个东西的人也买了….」或显示地方的妈妈们需要什么等等,背后都有海量资料在解算,来自以色列的研究团队还用海量资料来对抗癌症呢!
现代人罹癌的风险高,却苦无有效的疗方。现行的治疗方法,不论是传统化疗、放射性治疗或是靶标药物,都如七伤拳一般,伤敌一千、自损八百,即便消灭了癌症,身体也难以回到塬本的健康状态。如何只杀死癌细胞而不影响身体的正常细胞,仍然是个梦想。一个以色列团队的最新研究,把这个梦想往现实拉近了一大步,研究成果发表在生物学界知名的期刊《Cell》上,有趣的是,主要的研究人员都跨足了资讯工程的领域,因为他们用来对抗癌细胞的工具是「海量资料」的分析技术。
此研究利用一种被称为「合成致死」(Synthetic lethalit)的基因对,意指一对相对应的基因,若二者同时处于去活化状态(inactive),则细胞就无法存活。但只要其中一个基因是活化状态(active)[注],即便另一个去活化,细胞仍为正常存活。很像我们苏花公路的双向单线路段,若一线道封闭,管制一下还是可以通车,双向皆封,路就不通了。
(奇怪的是科学家怎么会把一个专业名词取做「合成致死」这种像二流科幻片的字眼呢?取做「二枪毙命」如何?至少可以从二流的科幻片变成不错的动作喜剧片。)
由于癌症与先天的基因缺陷或后天的基因突变有很大的关联,往往可在癌症细胞内发现去活化的基因,相同的基因在正常细胞内则处于活化状态,此时若以药物手段抑制该基因的「合成致死」配对,就可达到只杀死癌细胞而不影响正常细胞的疗效。
人类的基因组多达20000~25000组,加上基因活化/去活化的变数,产生更多的排列组合可能,来自各个实验及临床的数据形成了「海量资料」,要如何从这「海量资料」中分析出合成致死的基因对,就是本研究的主要课题。
如果二个基因是「合成致死」对,同时处于去活化状态,那么携带这对基因的细胞就已被「致死」了,相关的数据不会被纳入这个海量资料库内,所以研究团队采取反向的操作:首先,在细胞内同时去活化的基因们,彼此间一定不是合成致死对,可以将之排除;再来,研究团队比对暨有的shRNA资料库(shRNA 会抑制基因活化),可做进一步的筛选;最后,利用合成致死基因对的另一个特性:当他们处处活化状态时,常常会同时进行产出蛋白质的动作,称做基因共表现(coexpression),研究人员得以找出合成致死基因对的候选人。
这些以数据分析找到的合成致死基因对与已知的合成致死基因比对,有高度的相符。
一位关键的研究人员在酒醉后接受访问时表示:「塬本我想找到我跟老婆吵架的塬因,因此将会让她生气的行为当作资料库进行分析。这个研究后来失败了,因为会让老婆生气的变因太多,而且还是时间的函数。不过当时开发的软体,意外地适用于分析合成致死基因对的资料库。」(误)
研究团队同时指出,某些用于治疗其他疾病的药物,其实有抑制部份基因活化的作用,若该基因与癌细胞内的去活化基因为合成致命组,那么这些药就有用于治疗癌症的可能。
这个研究成果也开发出一片「旧药新用」的蓝海!(旧药已通过临床测试,所以发现旧药物的新用途比之开发新的药物,节省了许多成本。)
[注]:活化的基因代表会有「基因表现」(gene expression)。而基因表现的解释为基因中的DNA序列生产出蛋白质的过程。步骤大致从DNA转录成mRNA开始,一直到对于蛋白质进行后转译修饰为止。
基因的表现,首先需要将遗传资讯从DNA上转录至信使RNA,然后再通过转运RNA转译成蛋白质。
数据分析咨询请扫描二维码
CDA数据分析师在中国航信高科技产业园进行了面向测试度量的数据分析培训课程,培训人数近2 ...
2024-05-01CDA数据分析师走进深圳迈瑞生物医疗电子股份有限公司,在迈瑞总部展开了为期两天的培训,本次课程参训人员线上及线下近百人, ...
2024-05-01CDA数据分析师在合肥市对合肥阳光新能源科技有限公司开展了为期8天的企业内训。 合肥阳光新能源科技 ...
2024-05-01CDA数据分析师走进海尔大学,进行了《数据治理与数据中台建设的道与术》专题培训,培训现场爆满,近百人参加了此次培训。 ...
2024-05-01在中国银行苏州分行培训中心开始数据分析师培训,此次培训课程共10天内容,包括Excel、MySQL、概率论与数理统计、SPSS等内容, ...
2024-05-01从实际的业务需求出发,结合行业的典型应用特点,围绕实际的商业问题,探讨数据挖掘、机器学习模型在金融领域的应用,包括获客、信用评分、细分画像、交叉销售、反欺诈、违规识别、时序预测、运筹优化、流程挖掘九个方面,形成 ...
2024-05-01本次培训课程为线上+线下的模式,由于学员编程能力不一、部分学员没有编程基础,故提供统计学、python基 ...
2024-05-01华夏银行信用卡中心-机器学习培训 1、课程亮点 取材于业界一流企业和顶级咨询公司的行业实践;已经被证明是人人 ...
2024-05-01主 题:数据中台建设及数据分析应用主题分享 1. 数据中台市场洞察 2. 主流数据中台产品比较 3. 某企业数据中 ...
2024-05-01围绕“数据驱动”战略,全力打造我行 300 人数字化人才梯队,着力培养数字化管理人才、大数据专业团队 ...
2024-05-01在当今数据驱动的商业环境中,数据分析成为了企业决策的重要依据。通过对大量数据的收集、处理和分析,企业能够更好地理解市场 ...
2024-04-29在人工智能(AI)的世界里,提示词(Prompt)是一种强大的工具,它能够引导AI按照用户的需求产生特定的输出。本文将深入探讨AI ...
2024-04-29CDA立足未来职场,拓展前沿视野——对外经贸大学保险学院举办“三全育人大讲堂”分享行业最新动态。 ...
2024-04-294月2日,CDA数据分析师创始发起人兼协会理事长赵坚毅博士受邀在浙江万里学院举办了一场以“数字化能力在职场中的作用” ...
2024-04-29随机森林(Random Forests)现在机器学习中比较火的一个算法,是一种基于Bagging的集成学习方法,能够很好地处理分类和回归的问 ...
2022-12-23方差分析是数据分析中常用的一种统计分析方法,接下来让我们简单了解一下方差分析的基本思想和原理吧。 方差分析(Analysis ...
2022-12-23来源:关于数据分析与可视化 关于streamlit-aggrid 数据排序 表格样式的调整 数据 ...
2022-08-03作者:麦叔 定义 「把上面晦涩的概念汇成一句话就是:」 ❝ 回调函数就是一个被作为参 ...
2022-08-03现今,高学历人群日益增多,物以稀为贵的高学历光环淡去。无论本科生还是研究生,甚至博士生,求职竞争力都大不如前,就业压力越来越大。
2022-06-01某家企业10个人面试,有9个本科生……如何脱颖而出,除得体的举止和良好的沟通力外,证书成重要筹码,这也是很多人考证的关键所在。
2022-04-14