在 MySQL 数据库中，逻辑删除是指通过在表中添加一个额外的状态字段来标记某一行数据已被删除，而不是真正地将该行数据从数据库中删除。这种方式相比于物理删除可以保留更多的历史信息，并且可以方便地进行撤销操作，因此被广泛应用于需要保存历史数据的场景中。

然而，逻辑删除也会对索引以及性能造成一定的影响。

首先，逻辑删除会增加表的行数，导致索引变得更加庞大。由于每个被删除的行仍然存在于表中，所以在进行查询时，MySQL 引擎需要扫描更多的行，这会导致查询速度变慢。如果逻辑删除的行过多，可能会导致索引失效，进而影响查询效率和性能。

其次，由于逻辑删除需要额外的状态字段来标记每个被删除的行，这会占用更多的存储空间。如果表中存在大量的被删除行，那么这些额外的状态字段将会占用大量的存储空间，导致表变得越来越庞大。这也会对查询和索引性能产生负面影响，因为更多的数据需要被加载到内存中以支持查询操作。

除了这些直接的影响之外，逻辑删除还可能对备份和恢复操作产生一些不利影响。由于逻辑删除实际上并没有真正地将数据从数据库中删除，所以在备份和恢复时需要特别注意，否则可能会导致数据的不一致性。

针对这些问题，我们可以采取一些措施来最小化逻辑删除对索引以及性能的影响。例如：

1. 对于那些很少会被查询到的旧数据，可以考虑物理删除，以减少对索引和性能的影响。

2. 如果必须使用逻辑删除，则应该尽量避免在索引列上进行逻辑删除操作，因为这样会增加索引的扫描成本。同时，也应该尽可能地减少状态字段的占用空间，例如使用枚举型或整数类型代替字符串类型，以减少存储空间。

3. 定期清理被逻辑删除的数据，以避免过多的无用数据占用存储空间。定期清理可以通过设置自动化任务或手动执行 SQL 脚本等方式完成。

总之，逻辑删除是一种非常有用的技术，可以帮助我们保留历史数据并方便地进行撤销操作。但是，在使用逻辑删除时，我们应该时刻关注其对索引和性能的影响，并采取合适的措施来尽可能地降低这些影响。