MySQL 5.5的默认存储引擎是InnoDB，这并不意味着MyISAM引擎要被淘汰。事实上，MySQL中仍然有很多使用MyISAM引擎的应用程序和数据库。

然而，MySQL社区已经开始逐步推荐InnoDB作为首选存储引擎，因为它在性能、可靠性和事务支持方面具有优势。在高并发、大数据量和高可靠性要求的应用场景下，InnoDB表现更加出色。

MyISAM引擎最初在MySQL中广泛使用，这是因为它比InnoDB更简单、更轻量级，对于小型或只读的应用程序来说，MyISAM可以提供高性能。然而，随着互联网应用的快速发展，对数据一致性和事务支持的需求也越来越迫切，这时候InnoDB就成为了更好的选择。

InnoDB是一个支持事务和行级锁定的存储引擎。这使得它非常适合需要高并发、高可用性和高数据完整性的应用程序。相比之下，MyISAM不支持事务和行锁定，这意味着在高并发的情况下可能会出现数据不一致的问题，同时也不适合频繁的写入操作。

有一些应用程序仍然使用MyISAM引擎，这可能是因为它们已经存在了很长时间，或者数据量相对较小，或者只需要进行读取操作。对于这些应用程序来说，MyISAM引擎仍然是一个不错的选择。但是，随着时间的推移，这些应用程序也应该考虑迁移到InnoDB引擎上，以便在未来发展中获得更好的性能和可靠性。

总之，MyISAM引擎不会被淘汰，但是MySQL社区已经开始逐步推荐InnoDB作为首选存储引擎。在选择存储引擎时，应该根据实际应用场景和需求来进行选择，以确保数据库的性能和可靠性。